Apesar de intensamente prejudicada e mesmo delapidada pelas constantes mudanças de sede a que esteve sujeita desde a sua criação, a Biblioteca do IHGSC ainda conserva boa parte de sua valiosa coleção de livros, revistas e jornais organizada ao longo de mais de cem anos. Inclusive com algumas obras raras.

Na Capital do Estado é, sem dúvida, a mais completa em assuntos catarinenses. Somente no ano de 1999, recebeu mais de seiscentos volumes em doações, onde se destacou uma importante coleção de livros sobre os Açores, presente do Governo daquelas ilhas portuguesas.

A campanha que a direção do IHGSC tem desenvolvido junto às editoras sediadas em Santa Catarina está dando certo, pois várias delas já fizeram doações completas de suas edições, atualizando e aumentando o acervo da Biblioteca.

A Biblioteca do IHGSC, agora mais ampla, pois separou-se do Arquivo Histórico, está aberta diariamente ao público interessado, que em 1999 ultrapassou duzentos consulentes.